既に解決済みでしたら読み飛ばして下さい。
私も あつ様と全く同じ症状で悩んでおりました。きっかけは、職場のPCがwindows7からwindows10にバージョンアップしてからになります。問題のバーコードフォントはNEC-MW７_M2.2です。ディスプレイには正しく表示されるのですが、印刷すると文字情報にしかなりません。フィルメーカーでフォントの追加をしようとすると、他のアプリ（Microsoft Officeなど）には表示されるこのフォントが、ファイルメーカーには追加リストの候補に表示されません。ただし、レイアウト画面にはフォント名が正しく表示されます。職場全体のPCなのですが、ファイルメーカーを併用しているのは自分の部署だけなので、フォントを変更するわけにもいかず困っておりました。幸い画面には表示されていましたので、PDF出力したものを印刷してしのいでおります。フォントの変更などで解決しない場合はお試し下さい。